A Comissão de Pesquisa (CPq) do IAG tem o objetivo de apoiar e promover a pesquisa realizada no Instituto, atuando como interface entre os pesquisadores da Unidade e a Pró-Reitoria de Pesquisa, tanto na orientação sobre os auxílios oferecidos quanto no envio de solicitações. Além disso, a CPq também organiza eventos para divulgação da produção científica do Instituto, com destaque para o Simpósio de Iniciação Científica do IAG.
A composição da Comissão de Pesquisa é regida pelo Regimento do IAG (Capítulo VII, Artigo 26), e suas atribuições são estabelecidas pela Resolução CoPq nº 7863 (Artigo 3º). A CPq do IAG/USP é composta por Presidente e Vice-Presidente (escolhidos pela Congregação da unidade), por dois representantes docentes de cada Departamento (por eles indicados e homologados pela Congregação, portadores, no mínimo, do título de Doutor) e pela representação discente (eleita por seus pares, constituída por alunos regularmente matriculados nos cursos de graduação ou pós-graduação do Instituto, correspondente a 10% do total de membros docentes do colegiado).
